El Hospital Alto Guadalquivir fue inaugurado el 12 de mayo de 1999 por Manuel Chaves. Hasta el 1 de marzo de 2000 estuvo gestionado por el Servicio Andaluz de Salud (SAS), momento en el que pasó a ser gestionado por la Empresa Pública Hospital Alto Guadalquivir, actual Agencia Sanitaria Alto Guadalquivir.
Es el primero de los hospitales que se le adscribió. Está ubicado en la localidad jienense de Andújar, se encuentra entre las ciudades de Jaén y Córdoba (a 60 y 80 Km. respectivamente) y da cobertura sanitaria a más de 66.000 habitantes de la comarca. Los municipios de los que es área de referencia son: Andújar, Marmolejo, Villanueva de la Reina, Arjona, Arjonilla, Escañuela, Lahiguera y Lopera.

La plantilla del Hospital Alto Guadalquivir está compuesta por alrededor de 440 trabajadores, entre personal sanitario y no sanitario.
En cuanto a recursos materiales, el centro dispone de*:
CC.EE.
- Consultas Externas: 50
- Habitaciones de Hospitalización convencional: 31
- Habitaciones en la Unidad Especial: 34
- Total de camas: 100
- Hospital de Día Quirúrgico con 4 camas y 6 sillones
- Área de Reanimación Quirúrgica con 4 camas
QUIRÓFANOS
- Quirófanos: 4
- Salas de dilatación-paritorio: 2
- Salas de cirugía menor ambulatoria: 1
EQUIPOS DE DIAGNÓSTICO POR IMAGEN
- Ecógrafos: 15
- TAC: 1
- Mamógrafo: 1
- Telemando: 1
- Radiología convencional: 2
- Arcos quirúrgicos: 2
- Portátil: 2
- Ecocardiógrafos: 2
URGENCIAS
- Puestos de observación: 8
- Boxes de exploración adultos y niños: 5
OTROS RECURSOS
- Laboratorio: 1
- Gimnasio de rehabilitación y fisioterapia: 1
- Farmacia hospitalaria: 1
- Sala de endoscopias: 2
- Lactario: 1